
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物体 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
设计没想到
科学研究人士科学探究由于冷藏库箱时光延缓牛肉片片的光洁度、持反击式水轮机、色彩、分离铁含磷量、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4质量来分析力量安排人体细胞系的铁身亡情形。毕竟出现,冷藏库箱时光延缓后,牛肉片片的光洁度在第六天和第6天为强势增涨;持水功能较低;颜色图片变深,流失亮泽,鲜红颜色转为暗红颜色。不仅而且,分离铁、生物氧和MDA的含磷量为强势增添,人体细胞系凋亡率为强势变高。 实验人士取出与众各种不同于速冻时段的相关力量检样的核营养素,之后去SDS-PAGE解析,核营养素条带在与众各种不同于时段分布不均不光滑且似的性(图1a)。表明核球球淀粉酶在与众各种不同于检样中的展示现状,解析发掘同组检样的中六位数更加接近于同技术水平(图1b),详细说明相关力量检样核营养素兼具正常的组内似的性性和组间性别差喜欢的人。 球血清组学共鉴别出1996种球血清。以B0为比较组,筛分B1、B2、B4和B6中的球血清实行异同表达出来出爱具体阐述,共鉴别到375个DEPs。将火山图信息可视化,并表明FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.053个标准具体阐述DEP。可是右图1c-f如下,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别鉴别出22、33、73和140个DEPs,在其中分发型别调整6、11、32和8九个,调整16、22、41和5俩。聚类分析法工艺评估报告了不同的冷冻分阶段相关肩部肌肉进行中球血清的表达出来出爱,可是彰显相关肩部肌肉球血清表达出来出爱异同逐渐会自动储存时段的增添而增添(图1g)。
图1| 差异食品冷藏时间间隔的肌原辅料球蛋白质含量组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 对比剖析冷藏库用时的脂肪试样对比剖析血清剖析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁生亡淀粉酶肽的PRM参考值分折(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 基本概念KEGG含有不同之处把你想表达出来球蛋白的铁死亡视频共识机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物制品提供了TMT按量脂肪酸质组学枝术保障保障,拜谱生物制品已研制开发做好并设立了完整心智成熟的转录组学、脂肪酸组学、代谢率组学并且两组学合作企业产品枝术保障保障体系中,欢迎致电咨询!
参考选取期刊论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.