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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗体阳性动物群炎症因子聊天、寡核苷酸遮盖代价非常高或运行程序流程简化。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯硕士生导师队伍在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个高产出预算、跨植物物种、全网上平台兼容的全新解决方案。

杂志期刊简单介绍

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我国的小学科职业海瑞朗基因遗传的规律的的与发育成熟海洋生理学探讨所和我国的基因遗传的规律的的学着承办的國際学术性研究方案中文核心论文期刊杂志杂志,努力于宣传报道活力小学小学学科和中医药学基因遗传的规律的的学这个科技教育领域的创作性探讨成就。JGG 202多年度导致碳原子7.1,Scopus学术性研究方案中文核心论文期刊杂志杂志如何评价指标体系CiteScore 9.9,位居JCR 202多年度GENETICS & HEREDITY这个科技教育领域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY这个科技教育领域Q1区,位居我国的小学科职业海瑞朗中文核心论文期刊杂志杂志设计布局海洋生理学类项1区(Top中文核心论文期刊杂志杂志),基因遗传的规律的的学和什么是生化与碳原子海洋生理学小类双1区。

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那些是HEATag

婉转的“二合为一体”设计的

HEATag是由凝集素和HUH内切酶组成的整合蛋白质

「分析器」模块电源 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化装饰(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「无线电源连接器」板块 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)字段条型码进行共价接触。

“1+1>2”的功能:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样版标示与追根。

Fig1: HEATag各种方面标上操作过程构造图

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实际的检定

HEATag又有大多能打?

能否在各不相同要求下,满足母乳喂养猎物内部系单内部混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。学习团体为 HEATag 设备了多轮 “水压测试英文”,从内部系到内部核,从普通到高低温,从新鲜样表到固定住样表,全周边所有地方证实它的固界定和信得过性。

第1轮测试软件面对哺乳期部分动物组织系:的研究员采用了产自人、鼠、仓鼠八个种类的4类组织(HEK293T、K562、MEF、CHO),在空调温度下能 HEATag 符号后混合着测序。以后再利用的 11447 个组织中,85.66% 都能完成 HEATag 条状码精确匹配好到原种类,样表间交叠生态破坏极低,UMAP 聚类进行分析法进行分析同时也是直接的证明文件,HEATag 条状码与种类非特异聊天遗传基因组的特点高宽比完全一致。 紧接着,測試经济状况进十步提升等级:研究分析工人来尝试在 4℃下产品标签鲜新生殖神经组织上皮组织细胞、在室内温度下产品标签甲醇一定生殖神经组织上皮组织细胞,甚至会能能产品标签生殖神经组织上皮组织细胞质。报告单仍然出众:整个经济状况下,样板产品标签与外来物种内容均具备良好 的有关的性,分割准确的率超 95%。即使是甲醇一定会诱发稍微的转录本相互感染,生殖神经组织上皮组织细胞质准备产生小量 RNA 流动,生殖神经组织上皮组织细胞类型、的批注报告单仍然与鲜新样板恢复一样,声明书 HEATag 能能产品标签不一样加工处理经济状况下的科学实验样板。

Fig2: HEATag 可在有所不同水平下结束单细胞核转录组混样进行分析

够标签辅乳动植物和海上无脊柱动植物的原代组织

只要说内部系测试方法是 “基本知识题”,那机构样版那就是 “浮动题”, 此类样版常常因内部款式僵化、周围环境适应性能性异常,为标记符号新技术的 “瓶颈问题”,而 HEATag 恰恰舞在此类 “瓶颈问题” 上展现什么了胜机。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸企业,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不能被更准识别,其它具体細胞结构类型的聚类算法然而都明确可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海上海洋生物的更换性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 条状码与外来物种转录组具有着较高高度性,就没有现身因高盐条件造成的 “箭头就失效”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可控制辅乳期软体动物组织结构范本各种方面 scRNA-seq 探讨

Fig4: HEATag可保证 新鲜感浅海无脊梁骨昆虫重量 scRNA-seq 剖析

HEATag与受损细胞的紧密联系不用激发转录组的更为明显调整

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在实现标签工作的并且,不懂对险遭的转录混合物析出现电磁波辐射,维持了学习的数据的完美性。

Fig5: HEATag不想影响到样本量的 RNA 把你想表达出来模型

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未来生活可期

HEATag 能为单神经元科研引来哪个?

HEATag 的总价值,远不仅于 “解决处理图标疑问”,它的灵敏性和普遍性,还在为单癌细胞论述使用更好也许性

从操作场景中你看

HEATag 能合并从 “简略相对浅析”(如癌进行与没问题进行、药剂办理与参考)到 “大建设规模性科学研究”(如进行组织细胞核图谱绘图、mtk量诉求)的全依据诉求。根据 PIP-seq、Stereo-cell 等新技术性可扩张技术性的转型,HEATag 还能进每一步上升单组织细胞核科学研究的通量,注力科学研究组织进行大建设规模性的好项目。

从跨领域发展潜力方面看

HEATag 不禁应适宜转录组学,还能与表观人类基因组学、营养素质组学、个人空间组学等技艺紧密联系,依据订制指数和寡核苷酸队列,HEATag 可能简单靠拢各种不同的组学步骤流程,不危害信息捕捉深层。同样,通过HEATag还可能转型单组织细胞糖组学探索技艺。

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进行合作动态图片

拜谱生物工程与陈凯客座教授制定目标进行加盟意向但这并

需要大家关注的是,在 HEATag 方法展现什么出庞然大物运用空间的背景图案下,拜谱动物体已与我国南方海洋能资源科学合理与工程建设安徽测试设计室(安徽)陈凯讲解实现目标分式的运算合作的相关。夫妻之间筹划紧扣 HEATag 方法的文化产业发展落地实施、教育科学项目转换成等目标方向生成层次共建,推动相应控制成本费、跨外来物种的单血受损癌细胞箭头方法迅速运用于合理教育科学项目情景,为更加多测试设计室提供数据有效、资金的单血受损癌细胞分析用具,助推器教育科学项目工作中者在血受损癌细胞动物体学、海洋能资源动物体学、妇科疾病管理机制等范围达成更加多推动
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